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苹果手机短信中，即使已经读取了短信，仍然会显示未读标志，这可能是由于以下原因造成的。
1、短信本身可能存在问题或缺陷，导致系统无法正确识别短信的读取状态，此时可以尝试重启手机或更新系统版本来解决问题。
2、在某些情况下，即使短信已经被阅读，由于网络延迟等问题，短信的接收和发送状态可能无法及时更新，此时可以尝试等待一段时间或者检查网络连接是否正常。
3、如果使用了某些短信应用程序的特殊功能，例如短信置顶等，这些功能可能会影响短信的读取状态显示，可以尝试关闭这些功能或者尝试使用默认的短信应用程序来查看是否问题得到解决。
如果以上方法都无法解决问题，建议联系苹果官方客服寻求帮助，也可以尝试备份手机数据并恢复出厂设置，但请注意备份重要数据以防丢失。